В 2011 году был заключены договоры о сотрудничестве с МБОУ «СОШ №4 г.Лесосибирска» и МБОУ «СОШ №5 г.Лесосибирска» и на их базе организован филиал кафедры высшей математики, информатики и естествознания под руководством доцента, кандидата педагогических наук Т.В.Захаровой.
В 2019 году был заключен договор о сотрудничестве с МБОУ «СОШ №2 г.Лесосибирска» и на ее базе был организован социально-экономический класс "Управленец будущего" под руководством профессора, кандидата экономических наук, зав.кафедрой ВМИиЕ Л.Н. Храмовой.
В 2020 году был заключен договор о сотрудничестве и взаимодействии с МБОУ «СОШ №9 г.Лесосибирска» и на ее базе организован филиал кафедры ВМИиЕ под руководством доцента, кандидата педагогических наук Фирер А.В.
Кафедра высшей математики, информатики, экономики и естествознания активно сотрудничает с кафедрами алгебры, геометрии и методики их преподавания, кафедрой информатики и информационных технологий в образовании Красноярского государственного педагогического университета им. В.П.Астафьева; поддерживает тесные связи с головным вузом – Сибирским федеральным университетом.
